Con este proceso los paricipantes en el ensayo clínico se asignan al azar a grupos distintos (consultar Brazo), que recibirán intervenciones diferentes. Ni el investigador ni el paciente pueden escoger la intervención. Asignando los pacientes al azar a los distintos grupos de intervención, la comparación de los efectos de la intervención es más justa, porque los grupos serán similares en cuanto a pacientes y características de la enfermedad – conocidas y desconocidas – excepto en la intervención administrada. Por consiguiente, al final del ensayo clínico, toda diferencia que pudiera surgir en cuanto a eficacia y toxicidad a favor de una intervención específica, se podrá causalmente atribuír exclusivamente a esa intervención y no a diferencias preexistentes entre los grupos.
